产品名称:细菌基因组DNA纯化试剂盒(硅胶膜柱法)
英文名称:Bacterial DNA purification kit(Silica membrane)
产品编号与包装规格:
编号 | 产品类型 | 规格 |
---|---|---|
TQ001D0 | 分子试剂 | 50 份/盒 |
产品简介:用于细菌基因组DNA的小量提取,其原理是利用细胞裂解释放基因组DNA;随后利用蛋白酶K降解膜蛋白和缠绕DNA的核蛋白,使DNA充分游离;硅胶膜离心过滤可逆吸附基因组DNA;洗除蛋白质、脂质等杂质后,用洗脱液洗脱获得高纯度基因组DNA。使用本试剂盒提取的DNA可用于各种常规分子实验操作,包括酶切、PCR、分子杂交等实验。
储存条件及有效期:室温保存,有效期一年,2~8℃条件下储存更佳。储存过程中若溶液产生沉淀,使用前将其在室温放置一段时间或37℃条件下温育,待充分溶解后摇匀即可使用。
溶菌酶和蛋白酶K溶解后,和RNase一起-20℃存放。
样本类型:新鲜细菌培养液或菌落悬浮液。
细菌基因组DNA纯化试剂盒(硅胶膜柱法)试剂盒组成:
序号 | 产品组成 | 规格 |
1 | 悬浮液 | 17.5 mL |
2 | 裂解液 | 15 mL |
3 | 去蛋白缓冲液 | 24 mL(使用前加16 mL无水乙醇) |
4 | 漂洗液 | 15 mL(使用前加60 mL无水乙醇) |
5 | 洗脱液 | 10 mL |
6 | DNA硅胶膜吸附柱 | 50 套 |
7 | 蛋白酶K | 干粉 |
8 | 蛋白酶K配置液 | 1 mL |
9 | 溶菌酶 | 干粉 |
10 | 溶菌酶配置液 | 4 mL |
11 | RNase | 220 μL |
12 | 使用说明书 | 1份 |
提取得率:1 mL纯培养菌液对数生长期的菌液(107~109 cells)基因组DNA的提取量分别为:革兰氏阴性菌6~25 μg,革兰氏阳性菌为6~15 μg;OD260/280=1.7~1.9。
细菌基因组 DNA 纯化试剂盒(硅胶膜柱法)使用方法:
● 初次使用前请在去蛋白缓冲液和漂洗液中加入无水乙醇,参见瓶身标签或使用说明书。
● 将蛋白酶K的粉末倒入蛋白酶K配置液中,涡旋振荡充分混匀,浓度为20 mg/mL。
● 将溶菌酶干粉倒入溶菌酶配置液瓶中,涡旋振荡充分混匀,浓度为20 mg/mL。
1,吸取1~2 mL对数生长期细菌培养液于1.5 mL离心管中。12,000 r/min离心1 min,尽量吸除上清。
2,中收集的菌体沉淀加入120 μL悬浮液,充分悬浮后加入80 μL溶菌酶和4 μL RNase A 溶液,震荡混匀后,37℃水浴10~30 min。
● (革兰氏阴性菌水浴10~15 min,革兰氏阳性菌水浴20~30 min;若是难提取的葡萄球菌属细菌可加入1 μL 溶葡酶 (20 mg/mL)一起水浴。溶葡酶需客户自行购买)
● 对于难裂解的细菌如芽孢杆菌和葡萄球菌等,可把悬浮液用量增加至320 μL,和酶水浴后,加入200 mg左右玻璃珠(0.1~0.2 mm)高速涡旋10 min以进一步裂解细菌。静置1 min,取200 μL上清液至新的离心管中,再进行下一步。(玻璃珠需客户自行购买)
3,加入220 μL裂解液和20 μL蛋白酶K,立即涡旋振荡混匀,65℃~70℃水浴或金属浴10~15 min,溶液形成清亮的悬浮液。
● 先加裂解液再加蛋白酶K,避免蛋白酶K活性减弱。
● 裂解液加入后会产生白色沉淀,一般水浴或金属浴后会消失,不会影响后续提取。如溶液未变清亮,说明细菌裂解不彻底,可能导致DNA提取量减少或不纯。如提取菌体超过1.5 mL,可适当延长温育时间。
●( 可选)12,000 r/min离心1 min去除未裂解完全菌体,转移上清液至新的离心管中。
4,加入220 μL无水乙醇,振荡混匀,此时可能出现白色絮状沉淀,简短离心将内壁的液体离心到管底。
5,将所得的溶液和絮状沉淀全部加入DNA硅胶膜吸附柱上(吸附柱套入收集管中),12,000 r/min离心1 min,倒掉滤液,吸附柱套回收集管。
● 溶液中基因组DNA吸附在硅胶膜上,如发生堵塞,说明提取的菌体过量,应适当减少菌量或延长离心时间,直到所有的溶液顺利离心到收集管中为止。
6,加入500 μL去蛋白缓冲液,12,000 r/min离心1 min,倒掉滤液,吸附柱套回收集管。
☑ 去蛋白缓冲液初次使用前加入16 mL无水乙醇。
7,加入500 μL漂洗液,12,000 r/min离心1 min,倒掉滤液,吸附柱套回收集管。
☑ 漂洗液初次使用前加入 60 mL 无水乙醇。
8,再次加入500 μL漂洗液,12,000 r/min离心1 min,倒掉滤液,吸附柱套回收集管,再次12,000 r/min离心1 min,彻底去除吸附柱中残留的液体,室温放置2 min,去除残留的乙醇。
9,将吸附柱套入新的1.5 mL无菌的离心管中,向吸附柱中央处悬空滴加50~100 μL洗脱液,室温静置5 min,12,000 r/min离心2 min,离心得到的液体转移到无菌的EP管中,-20℃保存待用。
● 洗脱液可用无菌去离子水替代,但pH值应在8.0~8.5。
● 将洗脱液预热到60℃使用,可提高基因组DNA得率。
● 为提高基因组DNA提取得率,可将洗脱得到的溶液再次吸出滴加到吸附柱中央,静置几分钟后再次离心收集。
纯度及浓度检测分析:
1、提取得到的细菌基因组DNA片段可用紫外分光光度计测量浓度与纯度。
2、DNA在OD260处有明显的吸收峰,在此条件下,1 OD值的光密度相当于双链DNA浓度为50 μg/mL;单链DNA或2.RNA为40 μg/mL;寡核苷酸为20 μg/mL。
3、OD260/280=1.7~1.9,如果A260/280≤1.7或比值过低,表示受到蛋白(芳香族)或酚类物质污染,需要纯化样品。若DNA样品中A260/280≥2.0表明样品有RNA或DNA降解。
4、洗脱液使用去离子水时候,OD260/280会偏低,但不表示纯度低。
细菌基因组DNA纯化试剂盒(硅胶膜柱法)使用注意事项:
1、本试剂盒提取使用的器皿、移液器等均应为专用,离心管、枪头等一次性耗材需进行高压灭菌。操作人员应穿戴洁净工作服、口罩、帽子、使用一次性无粉手套。
2、使用新鲜培养的菌液,确保提取的基因组DNA不被降解。
3、加入悬浮液后应充分悬浮菌液,以免影响提取效果。
4、裂解液注意不要直接接触皮肤,如有接触请用大量清水冲洗。
5、去蛋白缓冲液和漂洗液使用后盖紧盖子,以免乙醇挥发影响抽提效果。
6、基因组DNA需长期保存,建议使用洗脱液洗脱,分装保存于-20℃或-80℃。
7、请严格按照本说明书操作步骤进行,不同批号的试剂若无特殊说明,请勿混合使用,并保证在有效期内使用该试剂盒,因操作不当导致的基因组DNA提取效果不佳,本公司概不负责。
8、妥善处理所有样本和试剂材料,彻底清洁和消毒操作台面。